Разработанный Енисейским губернатором А.П.Степановым проект размещения 5955 ссыльных в 22 казённых поселениях был утверждён 15 сентября 1827 года императором Николаем I.
В марте 1829 года были определены леса для вырубки. В 1830 году основано Сагайское казённое поселение для размещения в нём ссыльных. В следующие годы построены Салбинское, Ермаковское, Дубенское, Восточное, Тигрицкое.
В феврале 1831 года мкетрическая книга Курагинской церкви зафиксировала бракосочетание «деревни Сагайской умершаго поселенца Василия Бобова вдова Акулина вторым браком с Берёзовским поселенцем Исааком Савельевым». В это же время в Сагайском жили в течение нескольких лет Ксения Павлова Иванова, Кондрат Леонтьев Соловьёв, Фёдор Минеев Белогуров, Мария Фёдорова Бородина, Иван Демидов, Андрей Васильев, Василий Беляев и другие.
В исповедальных росписях по Каратузской Петропавловской церкви в 1856 году в Сагайске насчитывалось 106 дворов, в которых проживало 420 человек мужского пола и 325 женского.
Крестьяне, сосланные в Сибирь помещиками, солдаты и матросы, разжалованные за воинские проступки, взялись за раскорчевку делян под пашни, стали обзаводиться семьями, домашним хозяйством, чего нельзя было сказать о бродягах, приверженцах к легкой наживе.
Многие поселенцы были людьми одинокими, не имеющими семьи (88 человек в основном старше 50-ти лет), либо вновь её создавшие уже в преклонном возрасте. Так 68-летний Григорий Косьмин Чебаненко женился на Марии Ерофеевой 41 года.
В селе Шушенском была учреждена резиденция смотрителя казенных поселений: Сагайского, Сабинского, Ермаковского, Восточного, Дубенского, Тигрицкого.
Новые поселения строились по единому военно-казарменному типу. Прямые улицы, в центре прямоугольная площадь для церкви, казарма конвойной команды, канцелярия надзирателя из казаков Саянского форпоста.
Дома для ссыльных строились по четыре комнаты в каждом, разделенные коридором по две комнаты на каждой стороне. В каждой комнате помещалась отдельная семья. Дворы для ссыльных устраивались по одному для двух семей. Амбары того же типа, что и дом, только без коридора.
Тяжелое положение поселенцев осложнялось отсутствием в новых поселениях женщин.
Декабрист Александр Беляев, с разрешения минусинской полиции в 1836 году посетивший казенные поселения Восточное, Тигрицкое, Дубенское, Ермаковское, Сагайское, писал: «Селения красивые, правильные, возделывались быстро…Но проезжая эти красивые селения, какая-то грусть охватывала при виде этих пустынных улиц, ни одного женского лица, ни одного ребенка или кой-где как исключение».
Казенные поселения только в 1850 году были переведены в разряд деревень и вместо надзирателей стали управляться сельскими старостами.
В списках населенных мест (по сведениям 1859 г.) Российской империи, составленные и издаваемые Центральным Статистическим Комитетом Внутренних Дел в разделе Енисейская губерния значатся на проселочной дороге от города Минусинска к станице Каратузской деревни казенные: Сагайская, Верхний Кужебар, Моторское, Ширыштык, Средний Кужебар, Арсапка, Черемхова, Качулька, Уджей, Нижний Кужебар, Верхнее-Суэтукская, Верхнее-Буланская, Нижнее-Буланская.
В 1870 году они вошли в состав Тесинской волости, а в 1884 году была образована Сагайская волость с центром в селе Сагайском.
В Сагайской волости остались деревни и заимки: Бачурина, Верхняя Копь, Еловка (Полтавка), Золотухина, Изотова, Исаева, Каратуз, Качулька, Ключи, Козловка, Копь (Усть Копь), Лебедева, Малишевского, Нижний Кужебар, Николаевка, Ново Троицкая, Парышева, Полухина, Пономаревка, Сагайское, Селина, Синицина, Сосновское, Таскина, Уджей, Цыплятникова, Черемушка, Черепановка, Ягодный хутор.
В 1922 году Сагайская волость переименовалась в Каратузскую, Волостной Исполком из Сагайска переведен в село Каратузское.
Приказом № 52 Енисейского Губернского Исполкома 4 апреля 1924 года в енисейской губернии было введено районо-волостное деление. Каратузская, Моторская, Кужебарская волости образовали Каратузский район.
Предвестниками Октября были революции 1905-1906 годов, которые волной прокатились по всей царской России и положили начало активных выступлений рабочих и крестьян. Она коснулась и юга Енисейской губернии и в том числе Сагайскую и Моторскую волость.
Большую агитационную работу среди рабочих и крестьян проводили политические ссыльные, жившие в разное время в Сагайской волости: Антонина Максимильяновна Старкова, соратник В.И.Ленина, жившая в селе Сагайском; рабочий завода города Екатеринослава Смирнов; аптекарь Зефиров и студент из города Саратова Давид Гольберг; врач 4-го участка Минусинского округа Николай Федорович Николаевский; рабочий железнодорожных мастерских города Красноярска Лемзяков; врач, член РСДРП Алексей Петрович Лебедев.
Писарь Сагайской волости Дмитрий Монаков для проведения митингов и собраний предоставлял помещение волостного правления, часто выступал с призывом не платить подати и повинности, прекратил их раскладку на крестьян.
Многие вернувшиеся домой в 1917 году солдаты Первой империалистической войны были участниками штурма Зимнего дворца в Петрограде. Среди них Егор Харитонович Шаповалов, Федор Васильевич Кретов, Михаил Фокеевич Бородин из села Сагайского.
Но не долго продержалась Советская власть в селе. С прибытием в феврале 1918 года отряда Сотникова в казачью станицу Каратузскую, в волости объявлено военное положение.
Минусинский уездный комитет партии в связи с угрозой контрреволюционных действий отряда Сотникова принимает решение о создании в Минусинском уезде нескольких отрядов Красной гвардии. Такие отряды, в основном состоящих из вернувшихся с войны солдат, были созданы в Каратузе, Уджее, Старой Копи, Черемушке, Сагайском.
Активными участниками создания подпольной организации в селе Сагайском были Фёдор Кретов, Егор Шаповалов, Михаил Бородин. Во время крестьянского восстания они вошли в штаб армии, которой командовал Кульчицкий.
После поражения крестьянского восстания повсеместно началась расправа над повстанцами. Начались аресты и расстрелы. В Сагайске во дворе волостного правления было расстреляно 12 человек.
Жители села Сагайского принимали активное участие в борьбе против колчаковцев, войдя в состав партизанской армии Кравченко и Щетинкина.
В годы Великой Отечественной войны 1941-1945 гг. жители села Сагайского принимали активное участие в оказании помощи фронту. На полях колхоза трудились от мала до велика, а подрастающая молодёжь, как и их отцы, в свой срок уходили на фронт, сражаясь под Москвой и Сталинградом, защищая блокадный Ленинград. Одним из них был тракторист колхоза Николай Шишкин. За храбрость и находчивость он неоднократно награждался боевыми орденами и медалями, а за форсирование Днепра в 1943 году, Николай Васильевич Шишкин был удостоен звания Героя Советского Союза.
Многие солдаты из Сагайского остались на полях сражений Антонович Григорий Тихонович, Андросов Гавриил Никитович, Бордюгов Пётр Иванович, Бограцевич Пётр Иванович, Буланов Иван Романович,Губарев Семён Степанович, Ермолов Алексей Тимофеевич, Караблин Фёдор Гаврилович, Кащеев Василий Арсентьевич, Лащёв Степан Егорович, Павлов Афанасий нефёдович и многие другие
Всем погибшим в годы войны в селе установлен памятник.
В 1940-е годы на территории Сагайского сельсовета было три колхоза: им. Щетинкина, «Заветы Ильича» в селе Сагайском. В 50-е годы после укрупнения остался колхоз «Заветы Ильича». В 2001 году после реорганизации колхоз стал называться сельскохозяйственной производственной артелью. В2006 году стал победителем районных соревнований в отрасли животноводства среди сельскохозяйственных предприятий.
Село Сагайское находится в 7 километрах от районного центра на север.
В селе проживает более 600 человек, работает Сельский клуб, библиотека, ФАП, основная школа, детский сад, имеется частный магазин.